药物治疗
当急性上呼吸道感染消退后，患者可能仍有慢性化脓性鼻窦炎。从鼻腔和鼻窦流出的脓液流到鼻咽部的咽鼓管开口处引起咽鼓管持久阻塞，这时需要抗生素治疗。
全身因素对儿童抵制感染是至关重要的。某种血液蛋白的缺乏会导致感染的反复发作以及上感病程加长，这时需要定期地注射丙种球蛋白。
过敏也是分泌性中耳炎迁延不愈的重要原因。轻度过敏时，抗组胺药治疗就会有效。更加严重而持久的过敏需要过敏性评估和治疗，包括注射治疗。
同时，推荐咽鼓管充气治疗，就是将气体通过鼻子和咽鼓管吹入中耳腔以便于帮助缓解充血和重建中耳通气。吹气可以通过咽鼓管捏鼻鼓气法和中耳吹张法得到实现。咽鼓管捏鼻鼓气法就是捏住鼻子，使劲鼓气，让气体经咽鼓管进入中耳腔的方法。但是，当上感和有鼻涕时禁止用此法。中耳吹张法是通过特殊的注射器放入患耳侧后鼻孔咽鼓管开口处，气囊打气的同时进行吞咽动作来完成。这种方法也使气体进入咽鼓管和中耳腔。同样，当上感时禁止用此法。
手术治疗
手术治疗慢性分泌性中耳炎的主要目的是重建中耳通气管道，保护听力在正常水平以及防止因反复的感染所致的中耳粘膜和听小骨的破坏。这个包括鼓膜切开，置管，同时腺样体刮除。
鼓膜切开术即是在鼓膜上作切开以便于排出中耳腔的液体。通气管置入切口处防止切口的愈合以及确保中耳通气畅通。通气管暂时代替咽鼓管平衡中耳内外气压的功能。塑胶管通常保持3－9月，这期间咽鼓管的阻塞得到缓解。拔管后，鼓膜愈合；咽鼓管重新恢复平衡中耳内外气压的功能。
很少发生拔管后鼓膜不愈合的，但如果出现，穿孔可以经手术修补。
在成人，鼓膜切开和置管通常在局麻下医生办公室里完成。在小孩，需要全麻。如果腺样体肥大的话，应给予去除。一般拔管后不会再出现中耳通气问题。如果分泌性中耳炎复发，则需要再次置管。在一些难治患者，需要放置另一种更加持久类型的管子，“网孔”通气管。这种通气管较难放置，但放置后不容易自动脱落。在儿童，拔管也可能需要麻醉。有时，通气管拔除后鼓膜形成永久性穿孔，这需要咽鼓管功能正常后再把穿孔修补上。
通气管在位后，除禁止水进入耳道外没有其它活动限制。当淋浴、洗发、游泳时，医生会推荐你佩戴耳塞。
