任何影响咽鼓管周期性开放和关闭的原因都可以引起分泌性中耳炎。这些原因可以是先天性的（出生时就存在），也可以是由于感染或过敏以及腺样体阻塞咽鼓管所引起。
非成人咽鼓管
小孩咽鼓管的形状和大小与成人是不相同的。这就是小孩容易患分泌性中耳炎的原因。由于父母的遗传，有些小孩天生咽鼓管较小，所以中耳感染有家族倾向。随着孩子的成熟，咽鼓管通常呈现出成人的形状。
腭裂
腭裂患者也容易患有分泌性中耳炎。这是由于运动腭部的肌肉也是开放咽鼓管的肌肉。而在腭裂患者，这些肌肉往往是不全或畸形的。
感染
中耳内粘膜和咽鼓管粘膜是连续且类似的就像鼻腔、鼻窦和咽喉一样。这些部位的感染导致咽鼓管粘膜肿胀，粘膜肿胀引起咽鼓管阻塞。
变态反应
鼻部和咽喉部的过敏反应可导致粘膜肿胀，这些肿胀可影响到咽鼓管。过敏反应可以是急性的，如枯草热；也可以是慢性的，如多种“鼻窦炎”。
腺样体
腺样体位于鼻咽部，在两咽鼓管开口之间和周围的区域。当腺样体肿胀时可能阻塞咽鼓管开口。
